泉州湾港区水域范围在下垵村、大坠岛、小坠岛至古浮村连线以西。全港区分为内、外两港，内港位于金琦村以西水域的晋江内；外港即后渚作业区，位于入口至洛阳江内。后渚作业区为泉州湾港区主港。